Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9D1K7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D1K7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D1K7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D1K7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D1K7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D1K7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D1K7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D1K7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D1K7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Q9D1K7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D1K7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D1K7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D1K7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D1K7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D1K7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D1K7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D1K7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D1K7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D1K7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D1K7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D1K7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D1K7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D1K7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D1K7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D1K7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D1K7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D1K7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D1K7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D1K7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D1K7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D1K7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D1K7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D1K7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D1K7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D1K7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D1K7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D1K7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D1K7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D1K7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms