Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp11Q9CZJ1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp11Q9CZJ1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Utp11Q9CZJ1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Utp11Q9CZJ1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Utp11Q9CZJ1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Utp11Q9CZJ1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Utp11Q9CZJ1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Utp11Q9CZJ1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Utp11Q9CZJ1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Utp11Q9CZJ1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Utp11Q9CZJ1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Utp11Q9CZJ1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Utp11Q9CZJ1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Utp11Q9CZJ1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp11Q9CZJ1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp11Q9CZJ1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp11Q9CZJ1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp11Q9CZJ1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp11Q9CZJ1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp11Q9CZJ1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp11Q9CZJ1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp11Q9CZJ1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Utp11Q9CZJ1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Utp11Q9CZJ1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Utp11Q9CZJ1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms