Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS72

Filip1, Filamin-A-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Filip1Q9CS72 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Filip1Q9CS72 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Filip1Q9CS72 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Filip1Q9CS72 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Filip1Q9CS72 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Filip1Q9CS72 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Filip1Q9CS72 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Filip1Q9CS72 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Filip1Q9CS72 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Filip1Q9CS72 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Filip1Q9CS72 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Filip1Q9CS72 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Filip1Q9CS72 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Filip1Q9CS72 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Filip1Q9CS72 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Filip1Q9CS72 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Filip1Q9CS72 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Filip1Q9CS72 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms