Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TriobpQ99KW3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TriobpQ99KW3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms