Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krcc1Q99JT5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms