Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Shtn1Q8K2Q9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Shtn1Q8K2Q9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms