Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Fam228aQ8CDW1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam228aQ8CDW1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms