Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otol1Q4ZJM7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otol1Q4ZJM7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otol1Q4ZJM7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otol1Q4ZJM7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otol1Q4ZJM7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otol1Q4ZJM7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otol1Q4ZJM7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Otol1Q4ZJM7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Otol1Q4ZJM7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Otol1Q4ZJM7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Otol1Q4ZJM7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms