Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc27Q3V036 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc27Q3V036 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc27Q3V036 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc27Q3V036 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc27Q3V036 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc27Q3V036 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc27Q3V036 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc27Q3V036 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc27Q3V036 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc27Q3V036 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc27Q3V036 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc27Q3V036 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc27Q3V036 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc27Q3V036 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc27Q3V036 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc27Q3V036 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc27Q3V036 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc27Q3V036 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc27Q3V036 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc27Q3V036 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc27Q3V036 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc27Q3V036 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc27Q3V036 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc27Q3V036 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc27Q3V036 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms