Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skap1Q3UUV5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Skap1Q3UUV5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms