Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTW2

A530084C06Rik, RIKEN cDNA A530084C06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A530084C06RikQ3UTW2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
A530084C06RikQ3UTW2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
A530084C06RikQ3UTW2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
A530084C06RikQ3UTW2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
A530084C06RikQ3UTW2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
A530084C06RikQ3UTW2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
A530084C06RikQ3UTW2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
A530084C06RikQ3UTW2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
A530084C06RikQ3UTW2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
A530084C06RikQ3UTW2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
A530084C06RikQ3UTW2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
A530084C06RikQ3UTW2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
A530084C06RikQ3UTW2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
A530084C06RikQ3UTW2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
A530084C06RikQ3UTW2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
A530084C06RikQ3UTW2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms