Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syndig1lQ3USQ7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syndig1lQ3USQ7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms