Protein–RNA interactions for Protein: Q3U552

A930003A15Rik, RIKEN cDNA A930003A15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A930003A15RikQ3U552 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A930003A15RikQ3U552 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A930003A15RikQ3U552 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms