Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 453.6 ms