Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VgfQ0VGU4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VgfQ0VGU4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VgfQ0VGU4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms