Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pate4Q09098 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pate4Q09098 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms