Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Caprin2Q05A80 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Caprin2Q05A80 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Caprin2Q05A80 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Caprin2Q05A80 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Caprin2Q05A80 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Caprin2Q05A80 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Caprin2Q05A80 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Caprin2Q05A80 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Caprin2Q05A80 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Caprin2Q05A80 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Caprin2Q05A80 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Caprin2Q05A80 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Caprin2Q05A80 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Caprin2Q05A80 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Caprin2Q05A80 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Caprin2Q05A80 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Caprin2Q05A80 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Caprin2Q05A80 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Caprin2Q05A80 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Caprin2Q05A80 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Caprin2Q05A80 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Caprin2Q05A80 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Caprin2Q05A80 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Caprin2Q05A80 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Caprin2Q05A80 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Caprin2Q05A80 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms