Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sox12Q04890 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sox12Q04890 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sox12Q04890 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sox12Q04890 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sox12Q04890 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sox12Q04890 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sox12Q04890 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sox12Q04890 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sox12Q04890 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sox12Q04890 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sox12Q04890 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sox12Q04890 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sox12Q04890 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sox12Q04890 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sox12Q04890 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sox12Q04890 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sox12Q04890 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sox12Q04890 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sox12Q04890 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sox12Q04890 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sox12Q04890 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sox12Q04890 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sox12Q04890 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sox12Q04890 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sox12Q04890 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sox12Q04890 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sox12Q04890 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sox12Q04890 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sox12Q04890 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sox12Q04890 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sox12Q04890 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sox12Q04890 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sox12Q04890 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sox12Q04890 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sox12Q04890 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sox12Q04890 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sox12Q04890 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sox12Q04890 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sox12Q04890 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sox12Q04890 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sox12Q04890 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sox12Q04890 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sox12Q04890 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sox12Q04890 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sox12Q04890 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sox12Q04890 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sox12Q04890 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sox12Q04890 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sox12Q04890 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sox12Q04890 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Sox12Q04890 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sox12Q04890 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Sox12Q04890 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sox12Q04890 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sox12Q04890 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sox12Q04890 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Sox12Q04890 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Sox12Q04890 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sox12Q04890 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms