Protein–RNA interactions for Protein: Q04781

RKR1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, yeastyeast

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RKR1Q04781 CSC1YLR241W 2349 nt7.43□□□□□ -1.22
RKR1Q04781 RET1YOR207C 3450 nt7.43□□□□□ -1.22
RKR1Q04781 CCR4YAL021C 2514 nt7.43□□□□□ -1.22
RKR1Q04781 VHS1YDR247W 1386 nt7.42□□□□□ -1.22
RKR1Q04781 SDA1YGR245C 2304 nt7.42□□□□□ -1.22
RKR1Q04781 NOP58YOR310C 1536 nt7.42□□□□□ -1.22
RKR1Q04781 GPA1YHR005C 1419 nt7.42□□□□□ -1.22
RKR1Q04781 RFC2YJR068W 1062 nt7.42□□□□□ -1.22
RKR1Q04781 RTC1YOL138C 4026 nt7.41□□□□□ -1.22
RKR1Q04781 CEG1YGL130W 1380 nt7.41□□□□□ -1.22
RKR1Q04781 YJR124CYJR124C 1347 nt7.41□□□□□ -1.22
RKR1Q04781 MTM1YGR257C 1101 nt7.41□□□□□ -1.22
RKR1Q04781 NMD4YLR363C 657 nt7.41□□□□□ -1.22
RKR1Q04781 ATR1YML116W 1629 nt7.41□□□□□ -1.22
RKR1Q04781 FUM1YPL262W 1467 nt7.4□□□□□ -1.22
RKR1Q04781 VCX1YDL128W 1236 nt7.4□□□□□ -1.22
RKR1Q04781 RFA1YAR007C 1866 nt7.4□□□□□ -1.23
RKR1Q04781 RRP3YHR065C 1506 nt7.4□□□□□ -1.23
RKR1Q04781 COP1YDL145C 3606 nt7.39□□□□□ -1.23
RKR1Q04781 YDL012CYDL012C 324 nt7.39□□□□□ -1.23
RKR1Q04781 YGP1YNL160W 1065 nt7.39□□□□□ -1.23
RKR1Q04781 BSC5YNR069C 1470 nt7.39□□□□□ -1.23
RKR1Q04781 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt7.38□□□□□ -1.23
RKR1Q04781 SAP4YGL229C 2457 nt7.38□□□□□ -1.23
RKR1Q04781 DBP8YHR169W 1296 nt7.37□□□□□ -1.23
RKR1Q04781 YMR245WYMR245W 621 nt7.37□□□□□ -1.23
RKR1Q04781 ASK10YGR097W 3441 nt7.37□□□□□ -1.23
RKR1Q04781 ALD3YMR169C 1521 nt7.37□□□□□ -1.23
RKR1Q04781 ALD2YMR170C 1521 nt7.37□□□□□ -1.23
RKR1Q04781 DPB4YDR121W 591 nt7.37□□□□□ -1.23
RKR1Q04781 YDR417CYDR417C 372 nt7.37□□□□□ -1.23
RKR1Q04781 LUC7YDL087C 786 nt7.36□□□□□ -1.23
RKR1Q04781 MNN4YKL201C 3537 nt7.36□□□□□ -1.23
RKR1Q04781 TRP3YKL211C 1455 nt7.35□□□□□ -1.23
RKR1Q04781 GMH1YKR030W 822 nt7.35□□□□□ -1.23
RKR1Q04781 TLG2YOL018C 1194 nt7.35□□□□□ -1.23
RKR1Q04781 DSC2YOL073C 969 nt7.35□□□□□ -1.23
RKR1Q04781 RPL19AYBR084C-A 570 nt7.35□□□□□ -1.23
RKR1Q04781 IMA2YOL157C 1770 nt7.35□□□□□ -1.23
RKR1Q04781 VMA2YBR127C 1554 nt7.34□□□□□ -1.23
RKR1Q04781 APC4YDR118W 1959 nt7.33□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 PIC2YER053C 903 nt7.33□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 NSG2YNL156C 900 nt7.32□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 MET31YPL038W 534 nt7.32□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 ICY2YPL250C 411 nt7.32□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 SKG3YLR187W 3081 nt7.32□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 YMR102CYMR102C 2505 nt7.32□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 BUD22YMR014W 1560 nt7.31□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 RAD30YDR419W 1899 nt7.31□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 ZPS1YOL154W 750 nt7.31□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 YPL278CYPL278C 303 nt7.31□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 ALD6YPL061W 1503 nt7.31□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 RIM101YHL027W 1878 nt7.3□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 SED4YCR067C 3198 nt7.3□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 PRO2YOR323C 1371 nt7.3□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 SYG1YIL047C 2709 nt7.3□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 YGR153WYGR153W 654 nt7.3□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 APM2YHL019C 1818 nt7.3□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 GLC3YEL011W 2115 nt7.3□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 HXT14YNL318C 1623 nt7.3□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 ARB1YER036C 1833 nt7.3□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 YMR196WYMR196W 3267 nt7.29□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 DPH6YLR143W 2058 nt7.29□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 TUB3YML124C 1338 nt7.29□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 BRE2YLR015W 1518 nt7.29□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 RCR2YDR003W 633 nt7.29□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt7.29□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 MPH2YDL247W 1830 nt7.28□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 TYW3YGL050W 822 nt7.28□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 UBI4YLL039C 1146 nt7.28□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 SLT2YHR030C 1455 nt7.28□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 ROT2YBR229C 2865 nt7.28□□□□□ -1.24
RKR1Q04781 PUS1YPL212C 1635 nt7.27□□□□□ -1.25
RKR1Q04781 PUT1YLR142W 1431 nt7.27□□□□□ -1.25
RKR1Q04781 GTO1YGR154C 1071 nt7.26□□□□□ -1.25
RKR1Q04781 ASA1YPR085C 1332 nt7.26□□□□□ -1.25
RKR1Q04781 ALG6YOR002W 1635 nt7.26□□□□□ -1.25
RKR1Q04781 CBF5YLR175W 1452 nt7.26□□□□□ -1.25
RKR1Q04781 YOL075CYOL075C 3885 nt7.26□□□□□ -1.25
RKR1Q04781 RTC5YOR118W 1704 nt7.25□□□□□ -1.25
RKR1Q04781 TMA17YDL110C 453 nt7.25□□□□□ -1.25
RKR1Q04781 TRX2YGR209C 315 nt7.25□□□□□ -1.25
RKR1Q04781 KEX1YGL203C 2190 nt7.24□□□□□ -1.25
RKR1Q04781 YIL055CYIL055C 1884 nt7.24□□□□□ -1.25
RKR1Q04781 CBK1YNL161W 2271 nt7.24□□□□□ -1.25
RKR1Q04781 HST4YDR191W 1113 nt7.23□□□□□ -1.25
RKR1Q04781 YPR071WYPR071W 636 nt7.23□□□□□ -1.25
RKR1Q04781 RIA1YNL163C 3333 nt7.22□□□□□ -1.25
RKR1Q04781 SFB3YHR098C 2790 nt7.22□□□□□ -1.25
RKR1Q04781 NOG2YNR053C 1461 nt7.22□□□□□ -1.25
RKR1Q04781 RRN9YMR270C 1098 nt7.22□□□□□ -1.25
RKR1Q04781 YNG1YOR064C 660 nt7.22□□□□□ -1.25
RKR1Q04781 SUP35YDR172W 2058 nt7.22□□□□□ -1.25
RKR1Q04781 GAD1YMR250W 1758 nt7.22□□□□□ -1.25
RKR1Q04781 RSC6YCR052W 1452 nt7.21□□□□□ -1.25
RKR1Q04781 CMK2YOL016C 1344 nt7.21□□□□□ -1.25
RKR1Q04781 KRE28YDR532C 1158 nt7.21□□□□□ -1.25
RKR1Q04781 SFT2YBL102W 648 nt7.21□□□□□ -1.25
RKR1Q04781 LYP1YNL268W 1836 nt7.21□□□□□ -1.26
RKR1Q04781 EPS1YIL005W 2106 nt7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 50.4 ms