Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps11P62281 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps11P62281 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps11P62281 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps11P62281 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rps11P62281 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps11P62281 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps11P62281 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps11P62281 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps11P62281 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms