Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcmtd1P59913 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcmtd1P59913 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms