Protein–RNA interactions for Protein: P47753

Capza1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza1P47753 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capza1P47753 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Capza1P47753 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capza1P47753 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capza1P47753 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capza1P47753 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capza1P47753 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Capza1P47753 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capza1P47753 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capza1P47753 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capza1P47753 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Capza1P47753 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capza1P47753 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms