Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrcc6P23475 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Xrcc6P23475 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xrcc6P23475 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms