Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem254aP0DN89 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem254aP0DN89 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem254aP0DN89 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem254aP0DN89 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem254aP0DN89 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem254aP0DN89 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem254aP0DN89 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem254aP0DN89 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem254aP0DN89 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem254aP0DN89 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem254aP0DN89 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem254aP0DN89 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem254aP0DN89 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem254aP0DN89 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem254aP0DN89 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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