Protein–RNA interactions for Protein: P01793

Ig heavy chain V region HPCG13, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01793 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01793 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01793 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01793 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01793 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01793 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01793 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01793 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01793 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01793 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01793 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01793 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01793 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01793 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01793 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01793 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01793 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01793 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01793 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01793 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01793 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01793 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01793 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01793 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01793 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01793 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01793 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01793 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01793 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01793 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01793 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01793 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01793 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01793 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01793 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01793 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01793 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01793 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01793 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01793 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01793 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01793 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01793 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01793 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01793 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01793 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01793 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01793 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01793 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01793 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01793 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01793 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01793 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01793 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01793 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01793 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01793 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01793 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01793 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01793 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01793 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01793 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01793 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01793 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01793 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01793 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01793 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01793 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01793 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01793 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01793 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01793 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01793 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01793 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01793 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01793 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01793 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01793 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01793 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01793 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01793 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01793 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01793 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01793 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01793 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01793 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01793 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01793 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01793 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01793 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01793 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01793 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01793 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01793 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01793 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01793 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01793 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01793 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01793 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01793 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms