Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cops3O88543 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cops3O88543 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cops3O88543 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cops3O88543 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cops3O88543 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cops3O88543 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cops3O88543 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cops3O88543 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cops3O88543 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cops3O88543 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cops3O88543 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cops3O88543 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cops3O88543 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cops3O88543 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops3O88543 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops3O88543 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops3O88543 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops3O88543 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops3O88543 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops3O88543 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops3O88543 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cops3O88543 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms