Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Dnmt3bO88509 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms