Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rabep1O35551 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rabep1O35551 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rabep1O35551 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rabep1O35551 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rabep1O35551 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rabep1O35551 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rabep1O35551 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rabep1O35551 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rabep1O35551 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rabep1O35551 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rabep1O35551 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rabep1O35551 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rabep1O35551 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rabep1O35551 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rabep1O35551 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rabep1O35551 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rabep1O35551 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rabep1O35551 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rabep1O35551 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rabep1O35551 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rabep1O35551 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rabep1O35551 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rabep1O35551 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms