Protein–RNA interactions for Protein: O35427

Crcp, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrcpO35427 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CrcpO35427 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CrcpO35427 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CrcpO35427 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CrcpO35427 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CrcpO35427 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CrcpO35427 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CrcpO35427 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CrcpO35427 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CrcpO35427 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CrcpO35427 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CrcpO35427 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CrcpO35427 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CrcpO35427 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms