Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac1O09106 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac1O09106 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac1O09106 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms