Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ercc6F8VPZ5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Ercc6F8VPZ5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ercc6F8VPZ5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ercc6F8VPZ5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ercc6F8VPZ5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ercc6F8VPZ5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ercc6F8VPZ5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ercc6F8VPZ5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ercc6F8VPZ5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ercc6F8VPZ5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ercc6F8VPZ5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ercc6F8VPZ5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
Ercc6F8VPZ5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ercc6F8VPZ5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ercc6F8VPZ5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ercc6F8VPZ5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ercc6F8VPZ5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ercc6F8VPZ5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ercc6F8VPZ5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ercc6F8VPZ5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ercc6F8VPZ5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ercc6F8VPZ5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ercc6F8VPZ5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ercc6F8VPZ5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
Ercc6F8VPZ5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ercc6F8VPZ5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ercc6F8VPZ5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ercc6F8VPZ5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ercc6F8VPZ5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ercc6F8VPZ5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ercc6F8VPZ5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ercc6F8VPZ5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Ercc6F8VPZ5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ercc6F8VPZ5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ercc6F8VPZ5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ercc6F8VPZ5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ercc6F8VPZ5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ercc6F8VPZ5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ercc6F8VPZ5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ercc6F8VPZ5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ercc6F8VPZ5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ercc6F8VPZ5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ercc6F8VPZ5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Ercc6F8VPZ5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ercc6F8VPZ5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ercc6F8VPZ5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ercc6F8VPZ5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ercc6F8VPZ5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ercc6F8VPZ5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ercc6F8VPZ5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Ercc6F8VPZ5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ercc6F8VPZ5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ercc6F8VPZ5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ercc6F8VPZ5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ercc6F8VPZ5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ercc6F8VPZ5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ercc6F8VPZ5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ercc6F8VPZ5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ercc6F8VPZ5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ercc6F8VPZ5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ercc6F8VPZ5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ercc6F8VPZ5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ercc6F8VPZ5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ercc6F8VPZ5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ercc6F8VPZ5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ercc6F8VPZ5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ercc6F8VPZ5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ercc6F8VPZ5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ercc6F8VPZ5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Ercc6F8VPZ5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Ercc6F8VPZ5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Ercc6F8VPZ5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ercc6F8VPZ5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ercc6F8VPZ5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms