Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc146E9Q9F7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ccdc146E9Q9F7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms