Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aldh3b2E9Q3E1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms