Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc62E9PVD1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc62E9PVD1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms