Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hbb-bh2B2RVB7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hbb-bh2B2RVB7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms