Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms