Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVH6

1520401A03Rik, RIKEN cDNA 1520401A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms