Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdh13Q9WTR5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdh13Q9WTR5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms