Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trpc3Q9QZC1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms