Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmeff2Q9QYM9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmeff2Q9QYM9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms