Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx12Q9ER00 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Stx12Q9ER00 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx12Q9ER00 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms