Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQI5

Ppbp, Chemokine (C-X-C motif) ligand 7, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpbpQ9EQI5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PpbpQ9EQI5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms