Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ly6kQ9CWP4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ly6kQ9CWP4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms