Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX6

Gm16286, MCG141091, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16286Q9CQX6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm16286Q9CQX6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm16286Q9CQX6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm16286Q9CQX6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm16286Q9CQX6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm16286Q9CQX6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm16286Q9CQX6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm16286Q9CQX6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm16286Q9CQX6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm16286Q9CQX6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm16286Q9CQX6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm16286Q9CQX6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm16286Q9CQX6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms