Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RtcbQ99LF4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RtcbQ99LF4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RtcbQ99LF4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RtcbQ99LF4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RtcbQ99LF4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.8 ms