Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K4

Ccdc137, Coiled-coil domain-containing protein 137, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc137Q8R0K4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc137Q8R0K4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc137Q8R0K4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms