Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prkd3Q8K1Y2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prkd3Q8K1Y2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms