Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbm28Q8CGC6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm28Q8CGC6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms