Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phtf2Q8CB19 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Phtf2Q8CB19 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phtf2Q8CB19 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Phtf2Q8CB19 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phtf2Q8CB19 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Phtf2Q8CB19 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phtf2Q8CB19 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phtf2Q8CB19 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Phtf2Q8CB19 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Phtf2Q8CB19 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phtf2Q8CB19 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phtf2Q8CB19 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Phtf2Q8CB19 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phtf2Q8CB19 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phtf2Q8CB19 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phtf2Q8CB19 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phtf2Q8CB19 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phtf2Q8CB19 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phtf2Q8CB19 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phtf2Q8CB19 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phtf2Q8CB19 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phtf2Q8CB19 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phtf2Q8CB19 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phtf2Q8CB19 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phtf2Q8CB19 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phtf2Q8CB19 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Phtf2Q8CB19 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phtf2Q8CB19 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phtf2Q8CB19 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phtf2Q8CB19 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phtf2Q8CB19 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms