Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY9

Hist1h2bc, Histone H2B type 1-C/E/G, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h2bcQ6ZWY9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hist1h2bcQ6ZWY9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hist1h2bcQ6ZWY9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hist1h2bcQ6ZWY9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hist1h2bcQ6ZWY9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h2bcQ6ZWY9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h2bcQ6ZWY9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h2bcQ6ZWY9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h2bcQ6ZWY9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h2bcQ6ZWY9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h2bcQ6ZWY9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h2bcQ6ZWY9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h2bcQ6ZWY9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h2bcQ6ZWY9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h2bcQ6ZWY9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h2bcQ6ZWY9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h2bcQ6ZWY9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h2bcQ6ZWY9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h2bcQ6ZWY9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hist1h2bcQ6ZWY9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hist1h2bcQ6ZWY9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hist1h2bcQ6ZWY9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hist1h2bcQ6ZWY9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hist1h2bcQ6ZWY9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hist1h2bcQ6ZWY9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist1h2bcQ6ZWY9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist1h2bcQ6ZWY9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist1h2bcQ6ZWY9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist1h2bcQ6ZWY9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist1h2bcQ6ZWY9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist1h2bcQ6ZWY9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2bcQ6ZWY9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2bcQ6ZWY9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2bcQ6ZWY9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2bcQ6ZWY9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2bcQ6ZWY9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2bcQ6ZWY9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2bcQ6ZWY9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2bcQ6ZWY9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2bcQ6ZWY9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2bcQ6ZWY9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2bcQ6ZWY9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2bcQ6ZWY9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h2bcQ6ZWY9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h2bcQ6ZWY9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h2bcQ6ZWY9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h2bcQ6ZWY9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms