Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPL9

Ddx55, ATP-dependent RNA helicase DDX55, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx55Q6ZPL9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddx55Q6ZPL9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx55Q6ZPL9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ddx55Q6ZPL9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx55Q6ZPL9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx55Q6ZPL9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx55Q6ZPL9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx55Q6ZPL9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx55Q6ZPL9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx55Q6ZPL9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx55Q6ZPL9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx55Q6ZPL9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx55Q6ZPL9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms